Ia memulai bisnisnya di sektor perkayuan pada penghujung 1970-an di bawah perusahaan bernama PT Barito Pacific Timber (BRPT). Pasca pengurangan bisnis kanyunya, perusahaan ini berubah nama menjadi PT Barito Pacific (BRP) pada tahun 2007.
Pada tahun itu juga, perusahaan ini mengakuisisi 70% perusahaan PT Chandra Asri Petrochemical (TPIA), yang juga berdagang di Bursa Efek Indonesia (BEI).
Pada tahun 2011, PT Chandra Asri Petrochemical bergabung dengan PT Tri Polyta Indonesia Tbk., dan menjadi produsen petrokimia terintegrasi terbesar di Indonesia. Thaioil mengakuisisi 15% saham PT Chandra Asri Petrochemical pada tahun 2021.
Selain bisnis tersebut, Prajogo Pangestu bergerak di bisnis batubara. Perusahaannya di sektor ini bernama PT Petrindo Jaya Kreasi Tbk (CUAN).
Perusahaan ini, yakni CUAN, go publik pada bulan Maret 2023. Menurut rilis Forbes, Projogo Pengestu mencatatkan saham perusahaan energi terbarukan, Barito Renewables Energy, enam bulan kemudian pada bulan Oktober 2023.